Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CTNSO60931 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CTNSO60931 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CTNSO60931 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CTNSO60931 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNSO60931 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CTNSO60931 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms