Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VEGFDO43915 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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VEGFDO43915 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VEGFDO43915 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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