Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRKAB2O43741 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRKAB2O43741 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms