Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTATSF1O43719 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms