Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXA2O43364 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXA2O43364 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms