Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SRGAP3O43295 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms