Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SIAH2O43255 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms