Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SOCS1O15524 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOCS1O15524 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms