Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLIM4O00461 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLIM4O00461 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms