Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
O00370 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
O00370 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
O00370 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
O00370 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
O00370 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
O00370 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
O00370 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms