Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PIK3CDO00329 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PIK3CDO00329 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms