Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NFKBIEO00221 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NFKBIEO00221 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms