Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP23O00161 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP23O00161 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms