Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UBXN8O00124 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UBXN8O00124 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms