Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
J3KR12 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
J3KR12 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
J3KR12 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
J3KR12 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
J3KR12 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms