Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CROCC2H7BZ55 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CROCC2H7BZ55 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CROCC2H7BZ55 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CROCC2H7BZ55 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CROCC2H7BZ55 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CROCC2H7BZ55 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms