Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
SMIM1B2RUZ4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms