Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TMEM200CA6NKL6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms