Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
USP17L4A6NCW7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
USP17L4A6NCW7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms