Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00862A6NCI5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms