Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A1W2PQD8 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
A0A1W2PQD8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A0A1W2PQD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms