Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
FOXD1Q16676 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
FOXD1Q16676 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
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