Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NFIXQ14938 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NFIXQ14938 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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