Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ETFDHQ16134 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ETFDHQ16134 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms