Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHDQ96IW2 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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