Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ECM1Q16610 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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ECM1Q16610 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
ECM1Q16610 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
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