Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TWIST1Q15672 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms