Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
HOXD11P31277 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
HOXD11P31277 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
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