Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
DUSP4Q13115 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
DUSP4Q13115 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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