Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3FQ13275 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3FQ13275 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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