Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
U3KQ87 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQ87 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQ87 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQ87 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQ87 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQ87 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQ87 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
U3KQ87 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
U3KQ87 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
U3KQ87 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
U3KQ87 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms