Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
AUP1Q9Y679 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms