Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms