Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HECTD4Q9Y4D8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms