Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMC3Q9UQE7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMC3Q9UQE7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms