Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETD1BQ9UPS6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SETD1BQ9UPS6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms