Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TTF2Q9UNY4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms