Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BARX2Q9UMQ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BARX2Q9UMQ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms