Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK5

VANGL2, Vang-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL2Q9ULK5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VANGL2Q9ULK5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VANGL2Q9ULK5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VANGL2Q9ULK5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms