Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNMA3Q9UL41 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNMA3Q9UL41 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms