Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms