Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHIC2Q9UKJ5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHIC2Q9UKJ5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms