Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MRTO4Q9UKD2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MRTO4Q9UKD2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms