Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
USP21Q9UK80 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USP21Q9UK80 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms