Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPUSD1Q9UJJ7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RPUSD1Q9UJJ7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms