Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CYTH4Q9UIA0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CYTH4Q9UIA0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms