Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FBXO40Q9UH90 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms