Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms