Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLIP2Q9UDT6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms