Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC88CQ9P219 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms